Dungeons dikembangkan oleh Mojang Studios untuk Xbox One, Windows 10, PlayStation 4, dan Nintendo Switch menggunakan Unreal Engine 4.[7][8] Versi konsol sedang dibangunkan oleh Double Eleven.[9]

Dengan kejayaan berterusan Minecraft asal, Mojang memikirkan permainan lain yang mungkin dapat membawa sesuatu yang baharu ke dalam alam semesta Minecraft.[10] Mengeksperimen dengan idea yang berbeza, permainan ini pada mulanya dirancang untuk dijadikan sebagai permainan dungeon crawler pemain tunggal, yang diilhami oleh siri The Legend of Zelda untuk Nintendo 3DS.[11] Namun, ketika permainan ini mula dibentuk, elemen-elemen ini diubah atau dikeluarkan. Sebagai contoh, setelah menambahkan ciri multipemain, pasukan pengembangan menyedari bahawa perubahan ini menjadikan permainan lebih menyeronokkan.[12] Menurut pengarah permainan Måns Olsen, permainan ini diilhamkan oleh Diablo dan Torchlight,[7] serta permainan penembak orang pertama berpasukan seperti Warhammer: End Times - Vermintide dan Left 4 Dead.

Salah satu cabaran utama yang dihadapi oleh pasukan pengembangan adalah mencari cara untuk menyesuaikan cara mainan permainan dungeon crawl seperti Diablo ke dalam dunia Minecraft. Oleh kerana watak Minecraft tidak mempunyai kebolehan semula jadi yang istimewa, Mojang harus memikirkan alternatif untuk perkara seperti kelas watak yang biasanya terdapat dalam permainan genre itu. Penyelesaian mereka adalah untuk fokus pada penciptaan senjata dan perlindungan yang pemain boleh menguatkan melalui magis, membolehkan pemain meneroka kreativiti mereka melalui penyesuaian.[11][13]

Di samping itu, Mojang ingin memperkemas pengalaman permainan dungeon crawl tradisional menjadi sesuatu yang lebih mudah diakses. Olsen menyatakan bahawa permainan lain dalam genre itu "dapat didekati sampai tahap tertentu, tetapi mereka biasanya permainan dengan sistem yang sangat dalam dan saling berkaitan", dan bahawa mereka ingin menjadikan Minecraft Dungeons "sangat mudah" namun "langsung akrab".[14] Keputusan untuk tidak membenarkan pembinaan atau penciptaan, dasar Minecraft yang asli, juga dibuat untuk memfokuskan pada pengalaman dungeon crawler.[10] Untuk memberi cabaran kepada pemain yang lebih berpengalaman, pasukan pengembangan menambahkan pilihan untuk mengubah kesukaran permainan, yang akan memberi ganjaran kepada pemain dengan peralatan yang lebih baik dan kandungan rahsia baru kerana bermain dengan tahap yang lebih sukar.[13]

Minecraft Dungeons pertama kali diumumkan pada 28 September 2018 semasa acara siaran langsung Minecon.[15][16] Sebuah video yang mempamerkan cara mainan dilancarkan pada E3 2019.[17]